Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramel1Q99MW3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms