Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms