Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmp1Q99KU0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms