Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TirapQ99JY1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TirapQ99JY1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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