Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GatbQ99JT1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms