Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nrif1Q923B3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrif1Q923B3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms