Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi2Q920Q6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msi2Q920Q6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms