Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms