Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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