Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Txndc11Q8K2W3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Txndc11Q8K2W3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms