Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc12Q8K2L8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc12Q8K2L8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms