Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdc34Q8CFI2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdc34Q8CFI2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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