Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hpf1Q8CFE2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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