Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc73Q8CDM4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc73Q8CDM4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms