Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrif1Q8CDD9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lrif1Q8CDD9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Lrif1Q8CDD9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lrif1Q8CDD9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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