Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot2Q8C5L3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms