Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms