Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccser1Q8C0C4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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