Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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