Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ell3Q80VR2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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