Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms