Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfrkbQ6PIJ4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfrkbQ6PIJ4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms