Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rrp12Q6P5B0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rrp12Q6P5B0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms