Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt72Q6IME9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms