Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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