Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttf1Q62187 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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