Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkd1Q62101 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms