Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gp49aQ61450 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gp49aQ61450 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms