Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tcf12Q61286 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms