Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Clns1aQ61189 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clns1aQ61189 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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