Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ift20Q61025 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ift20Q61025 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms