Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P4ha2Q60716 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms