Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms