Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms