Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms