Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV70

Pdp1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp1Q3UV70 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdp1Q3UV70 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdp1Q3UV70 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms