Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp560Q3URI6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms