Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms