Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms