Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Yipf3Q3UDR8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms