Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calr4Q3TQS0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms