Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp39Q3TIX9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms