Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc13Q3TIR1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc13Q3TIR1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms