Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Jmjd8Q3TA59 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms