Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo3Q2TJ95 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms