Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q08AU9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q08AU9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q08AU9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q08AU9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q08AU9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q08AU9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms