Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gata4Q08369 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms