Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddr1Q03146 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddr1Q03146 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms