Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RykQ01887 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RykQ01887 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms