Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb1Q00420 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabpb1Q00420 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms